全院工作会议于2010年1月25日至26日上午在院机关驻地召开，会议的主要任务是贯彻落实中央农村工作会议和全国农业工作会议、农业科技工作会议、中央一号文件以及省有关会议精神，实事求是地总结全院2009年的工作，对做出突出成绩的单位、实绩突出的企业以及科技创新团队进行表彰，安排部署2010年的工作。
会上，院长王慧军作了题为《加快科技创新有效服务三农努力开创全院事业发展新局面》的工作报告。报告对于2009年的工作给予充分的肯定，认真分析了存在的问题，部署了全院2010年的重点工作。会议分组讨论了王慧军院长的工作报告、院四项重点工作2010年实施方案以及《关于对做出突出成绩的单位和个人进行表彰奖励的暂行办法（讨论稿）》，各小组组长就讨论结果向大会作了汇报。
最后，院党委书记胡木强就如何抓好全年工作任务落实讲了四点意见：一是抓落实，科学决策是前提；二是抓落实，真抓实干是核心；三是抓落实，领导带头是关键；四是抓落实，监督检查是保障。胡书记提出在全院形成领导干部带头抓落实、主管部门具体抓落实、相关部门配合抓落实、干部职工支持并参与抓落实的强大合力，把全院各项工作落到实处。
参加会议的有：院领导、所处级干部以及院（所）控股公司董事长、总经理以及离退休老领导。大会还特别邀请了国家半干旱工程中心主任、各地市农科院（所）长参加。