为提高我院财政项目推荐的科学性、可行性和准确性，院于2008年7月25日在旱作所深州试验站组织召开了2009年度财政项目论证会。项目评委由院重点项目领导小组全体成员及省财政厅有关职能处室负责人组成。项目申报单位负责人、项目主持人及申报单位财务负责人参加了会议。
2009年度财政项目共筛选了22项目参加了论证，其中条件建设项目3项、研发类项目17项、人才工程1项、科技服务类项目1项。研发类项目由15个创新团队组织申报。论证会由王慧军院长主持。会议首先由项目主持人以多媒体的形式进行汇报，经专家组质疑答辩、评议后，对论证项目给予打分排序形成最终评审结果。会后，财政厅的有关专家结合项目论证情况，对我院项目申报工作给予了点评，受到了广大与会者的好评。2009年度财政推荐论证项目总体上能紧紧围绕我院两大科技创新服务计划工程，依托创新团队组织筛选，选题方向明确，紧切学科发展前沿，面向“三农”发展瓶颈，组织重大科技攻关，提升科研平台，培育创新队伍，符合财政支持方向。但也存在研究内容重点不突出，绩效目标不明确，科研力量分散，研究战线过长等问题，有待进一步修改完善。