本发明公开了一种解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)菌株HMB28388,该菌株保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,其保藏编号为CGMCC No.13210。本发明还公开了利用该菌株生产的微生物菌剂,以及在防治黄瓜靶斑病等植物病害上的应用。本发明HMB28388菌株对黄瓜靶斑病的药效高,平均防效在90.0%以上;其次,利用本发明菌株防治黄瓜靶斑病不易产生抗药性,并且没有环境污染问题,制备和使用简单,成本低;此外,HMB28388菌株抑菌谱广,除黄瓜靶斑病菌外,还对棉花黄萎病菌、棉花枯萎病菌、棉花立枯病菌或番茄灰霉病菌等有很好的抑制作用。